Research Agent Skills
AI × 科研工具合集

10个热门科研 Agent Skills
使用场景与教程

从论文写作到实验自动化,从生物信息到医学统计——覆盖全学科的 AI 科研技能库一览

10
Skills 合集
700+
子技能模块
5+
支持平台
01
📚
Academic Research Skills
通用科研工作流
论文规划 文献综述 模拟审稿
一套通用科研工作流,覆盖研究问题梳理、文献综述、论文结构规划、各章节写作、多角色模拟审稿、论文修改与最终检查。
GitHub: Imbad0202/academic-research-skills

它能做什么

  • 研究问题梳理
  • 文献综述
  • 论文结构规划
  • 摘要、引言、方法和实验章节写作
  • 多角色模拟审稿
  • 论文修改和最终检查
  • 引用真实性和论点支撑关系检查
  • 代码实验和结果整理

最适合的场景

  • 只有一个模糊方向,不知道如何形成研究问题
  • 需要完成综述、开题报告或完整论文
  • 论文内容很多,但章节之间逻辑混乱
  • 担心 AI 编造文献或错误引用
  • 投稿前希望模拟审稿
  • 收到审稿意见后,需要系统返修

Claude Code 安装

/plugin marketplace add Imbad0202/academic-research-skills
/plugin install academic-research-skills

使用示例:规划论文

/ars-plan

我的研究方向是图谱增强 RAG,目前已完成一组初步实验。
请通过提问帮助我明确研究问题、创新点、实验设计和论文结构。
不要直接替我编造创新点。

使用示例:投稿前审稿

请使用 Academic Research Skills 对 manuscript 文件夹中的论文进行投稿前审查。

目标会议:ACL
重点检查:
1. 创新点是否清晰
2. 实验是否支持结论
3. 是否存在夸大表述
4. 引用是否真实
5. 审稿人最可能提出哪些问题

先输出问题清单,不要直接修改原稿。
⚠️ 它能检查论文逻辑,但不能替代作者对研究价值、实验真实性和领域知识的判断。
02
🧬
Scientific Agent Skills
自然科学技能库 · ~148 Skills
生物信息 化学信息 药物发现
自然科学专业技能库,包含大量科学数据库、Python 软件包和分析流程,覆盖生物信息学、单细胞分析、基因组与蛋白质分析、化学信息学等。
GitHub: K-Dense-AI/scientific-agent-skills

主要覆盖领域

  • 生物信息学
  • 单细胞分析
  • 基因组与蛋白质分析
  • 化学信息学
  • 分子模拟
  • 药物发现
  • 医学数据分析
  • 科研统计与绘图
  • 时间序列和网络分析
  • 文献与数据库检索

一键安装

npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills

# 安装指定 Skill
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills scanpy

使用示例:单细胞分析

请优先调用 Scientific Agent Skills 中与 Scanpy、差异表达、
通路富集和科学可视化相关的 Skill。

任务:
1. 读取 data 文件夹中的 10X 单细胞数据
2. 执行质量控制和双细胞检查
3. 完成标准化、降维和聚类
4. 给出细胞类型注释建议
5. 进行差异表达分析
6. 输出可复现的 Python 脚本
7. 将结果保存到 results 文件夹

不要直接删除异常样本,先输出质量控制报告。

使用示例:科研绘图

请使用 scientific-visualization Skill,根据 results.csv 生成投稿级图片。

要求:
1. 适合双栏论文
2. 使用色盲友好配色
3. 保留误差棒
4. 输出 PDF、SVG 和 300 DPI PNG
5. 同时保存完整绘图代码
6. 不得修改原始数据
⚠️ 部分 Skill 会调用外部数据库、API 或专业软件,需要额外配置。生成的医学和实验结论必须由专业人员审核。
03
🌱
nature-skills
中文科研综合技能库
论文润色 论文转PPT 审稿回复
面向中文科研用户的综合型技能库,覆盖论文阅读、中英文对照翻译、英文学术润色、科研绘图、论文转组会PPT、模拟审稿等全流程。
GitHub: Yuan1z0825/nature-skills

主要覆盖

  • 论文阅读
  • 中英文对照翻译
  • 英文学术润色
  • 摘要、引言和讨论写作
  • 科研绘图与论文示意图
  • 模拟审稿
  • 审稿意见回复
  • 文献检索与引用整理
  • 论文转组会 PPT
  • 论文转专利材料

Codex 安装

git clone https://github.com/Yuan1z0825/nature-skills.git
cd nature-skills
bash scripts/update-codex-skills.sh --pull
bash scripts/update-codex-skills.sh --check

使用示例:论文润色

请使用 nature-polishing 处理 manuscript/introduction.docx。

要求:
1. 不改变原始科学含义
2. 删除重复和空泛表达
3. 提升段落之间的逻辑关系
4. 不编造引用、结果或实验
5. 输出英文修改稿
6. 另外列出主要修改理由

使用示例:论文转 PPT

请使用 nature-paper2ppt,把 papers/paper.pdf 制作成中文组会汇报。

要求:
1. 12—15 页
2. 不要机械照搬论文章节
3. 保留关键实验图
4. 每张图标注原论文来源
5. 重点讲清研究问题、方法、实验和局限
6. 输出可编辑 PPTX
⚠️ 所谓"Nature 风格"主要指表达、结构和视觉目标,不代表生成结果自动达到 Nature 的研究质量。
04
🤖
Auto-Research-In-Sleep (ARIS)
自动化 ML 科研工作流
自动实验 消融实验 Rebuttal
自动化程度较高的机器学习科研工作流,可连接研究方向分析、论文阅读、创新点生成、代码库分析、实验设计、自动运行实验、结果分析、论文写作、自动审稿和 Rebuttal。
GitHub: wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep

完整工作流

  • 研究方向分析 → 论文阅读 → 创新点生成
  • 代码库分析 → 实验设计 → 自动运行实验
  • 结果分析 → 论文写作 → 自动审稿
  • Rebuttal → 多模型交叉检查

安装方式

# Git Bash / WSL
git clone https://github.com/wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep.git
bash Auto-claude-code-research-in-sleep/tools/install_aris.sh ~/your-project

# Windows PowerShell
tools/install_aris.ps1

使用示例:从研究方向开始

/research-pipeline "图神经网络增强的多模态 RAG"

目标:寻找普通硕士可以在三个月内完成的改进方向。

限制:
1. 优先使用公开数据集
2. 优先选择有开源代码的基础工作
3. 单卡 24GB 显存可以运行
4. 不允许把简单换模型包装成重大创新
5. 所有文献必须核验
6. 在运行大规模实验前必须等待人工确认

使用示例:Rebuttal

/rebuttal "paper/ + reviews/" — venue: ICML, character limit: 5000
⚠️ 不要真的完全"睡觉不管"。建议设置人工检查点:创新点确定前、修改代码前、大规模实验前、删除数据前、写入论文结论前、投稿前。
05
AI-Research-SKILLs
AI 研究工程技能库 · ~98 Skills
模型微调 推理部署 分布式训练
专门面向 AI 研究和工程,覆盖约 98 个 Skill、23 个类别,包括模型架构、Tokenizer、数据处理、微调、后训练、强化学习、分布式训练、模型压缩、推理部署等。
GitHub: Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs

23 个类别

  • 模型架构、Tokenizer、数据处理
  • 微调、后训练、强化学习
  • 分布式训练、模型压缩、推理部署
  • 模型评测、RAG、Agent
  • 多模态、MLOps、可观测性
  • 机械可解释性、研究选题
  • 论文写作和科研绘图

支持 vLLM、DeepSpeed、PEFT、TRL、LLaMA-Factory 等专业工具

一键安装

# 安装
npx @orchestra-research/ai-research-skills

# 更新
npx @orchestra-research/ai-research-skills update

# 查看已安装
npx @orchestra-research/ai-research-skills list

使用示例:大模型微调

请调用 AI-Research-SKILLs 中与 PEFT、LLaMA-Factory、
数据处理和模型评测有关的 Skill。

任务:
使用 data/train.jsonl 对 Qwen 系列模型进行 LoRA 微调。

环境:
1. 单张 24GB 显卡
2. Windows + WSL
3. 训练数据约 20 万条
4. 需要支持断点续训

请先输出:
1. 数据格式检查结果
2. 显存估算
3. 训练配置
4. 风险点
5. 评测方案

等待确认后再生成训练脚本。
⚠️ 它更偏研究工程,不是专门的通用论文写作工具。
06
✍️
Research Paper Writing Skills
论文写作 Skill · 轻量专注
结构优化 投稿自审 逻辑检查
体量较小、用途集中的论文写作 Skill,面向机器学习、计算机视觉和自然语言处理论文,覆盖 Abstract 到 Conclusion 各章节写作及投稿前自审。
GitHub: Master-cai/Research-Paper-Writing-Skills

覆盖章节

  • Abstract
  • Introduction
  • Related Work
  • Method
  • Experiments
  • Conclusion
  • 段落逻辑与论点证据检查
  • 投稿前自审

Claude Code 安装

git clone https://github.com/Master-cai/Research-Paper-Writing-Skills.git
cd Research-Paper-Writing-Skills

mkdir -p ~/.claude/skills
cp -R research-paper-writing ~/.claude/skills/

# Codex
mkdir -p ~/.codex/skills
cp -R research-paper-writing ~/.codex/skills/

使用示例:修改引言

请使用 research-paper-writing Skill 修改 manuscript/introduction.md。

目标:
1. 明确研究背景
2. 明确现有方法的具体不足
3. 自然引出本文方法
4. 清楚列出贡献
5. 删除无法由文献或实验支持的夸张表述
6. 保持全文在 900—1100 个英文单词之间

先分析原稿存在的问题,再输出修改稿。

使用示例:检查实验章节

请使用 research-paper-writing Skill 审查 Experiments 部分。

重点检查:
1. 实验是否回答了论文的核心问题
2. 对比方法是否公平
3. 是否缺少消融实验
4. 表格中的结论是否被过度解读
5. 是否需要报告方差、随机种子或置信区间

不要编造任何实验结果。
07
🗂️
Claude Scholar
长期科研项目管理系统
Zotero 集成 Obsidian 联动 实验日志
长期科研项目管理系统,把科研过程组织为:研究问题 → 文献证据 → 实验 → 数据分析 → 研究结论 → 论文写作,并连接 Zotero 文献库、Obsidian 知识库、实验日志等。
GitHub: Galaxy-Dawn/claude-scholar

科研全流程管理

  • 研究问题 → 文献证据 → 实验
  • 数据分析 → 研究结论 → 论文写作
  • 连接 Zotero 文献库
  • 连接 Obsidian 知识库
  • 项目代码、实验日志、实验结果管理
  • 论文草稿、Rebuttal、每日科研记录

安装方式

# Git Bash / WSL
git clone https://github.com/Galaxy-Dawn/claude-scholar.git
bash claude-scholar/scripts/setup.sh

# Claude Code 插件
/plugin marketplace add Galaxy-Dawn/claude-scholar
/plugin install claude-scholar@claude-scholar

使用示例:开始新课题

请使用 Claude Scholar 帮我建立一个新的研究项目。

主题:多模态知识图谱增强 RAG。

请完成:
1. 将宽泛主题拆成具体研究问题
2. 建立文献分类框架
3. 提出需要验证的关键假设
4. 建立实验记录模板
5. 规划未来四周的研究任务
6. 明确哪些内容是已知事实,哪些只是待验证猜想

使用示例:整理 Zotero 文献

请分析 Zotero 中 Graph RAG collection。

按照以下维度分类:
1. 图结构类型
2. 检索方式
3. 推理方式
4. 数据集
5. 是否开源
6. 主要不足
7. 可以继续研究的空白

不得只依据标题和摘要下结论。
⚠️ Zotero、Obsidian 和 MCP 等能力需要额外配置,不是安装完成后全部自动连接。
08
📊
Auto Empirical Research Skills
社会科学实证研究技能库
因果推断 DID/IV/RDD Stata/R/Python
面向社会科学实证研究的大型技能目录,覆盖经济学、管理学、教育学、社会学、心理学等学科,方法涵盖 OLS、面板数据、DID、IV、RDD、合成控制、PSM 等。
GitHub: brycewang-stanford/Auto-Empirical-Research-Skills

学科覆盖

  • 经济学、管理学、教育学
  • 社会学、心理学、政治学
  • 国际关系、公共管理、传播学

方法覆盖

  • OLS、面板数据、双重差分 (DID)
  • 工具变量 (IV)、断点回归 (RDD)
  • 合成控制、倾向得分匹配 (PSM)
  • 中介效应、异质性分析、稳健性检验
  • 因果机器学习
  • Stata、R 和 Python

安装方式

# 添加插件市场
claude plugin marketplace add brycewang-stanford/Auto-Empirical-Research-Skills

# 安装 Python 实证分析流程
claude plugin install empirical-analysis-python@auto-empirical-research-skills

# 安装 Stata 流程
claude plugin install empirical-analysis-stata@auto-empirical-research-skills

# 安装 R 流程
claude plugin install empirical-analysis-r@auto-empirical-research-skills

使用示例:DID 研究

请使用 empirical-analysis-python Skill 分析 data/policy.csv。

研究问题:某项政策是否提高了企业研发投入。

请完成:
1. 检查数据结构和缺失值
2. 明确处理组、对照组和政策时间
3. 生成描述性统计
4. 进行平行趋势检验
5. 运行基准 DID
6. 进行稳健性和安慰剂检验
7. 分析异质性
8. 输出可复现代码、表格和图片

在确认变量定义之前,不要直接运行最终回归。
⚠️ 因果推断是否成立,关键取决于研究设计和识别假设,而不是代码能不能运行。Skill 无法替代对平行趋势、工具变量有效性和样本选择偏差的判断。
09
🔧
codex-claude-academic-skills
中文工科三合一技能
MATLAB 仿真 信号处理 论文转PPT
包含三个互补 Skill:research-writing-skill(论文写作)、office-academic-skill(PDF/PPT/Word 处理)、scientific-toolkit-skill(MATLAB/Python 科学计算),特别面向中文工科研究生。
GitHub: zLanqing/codex-claude-academic-skills

三套互补 Skill

  • research-writing-skill:论文正文写作、摘要引言、方法实验、论文润色、审稿意见回复
  • office-academic-skill:PDF 论文阅读报告、Word 文档、组会/开题/中期/答辩 PPT
  • scientific-toolkit-skill:MATLAB/Octave、Python 科学计算、信号和图像处理、统计分析、机器学习、数值仿真、科研绘图

安装方法

git clone https://github.com/zLanqing/codex-claude-academic-skills.git
cd codex-claude-academic-skills

# Claude Code
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -R research-writing-skill ~/.claude/skills/
cp -R office-academic-skill ~/.claude/skills/
cp -R scientific-toolkit-skill ~/.claude/skills/

# Codex
mkdir -p ~/.codex/skills
cp -R research-writing-skill ~/.codex/skills/
cp -R office-academic-skill ~/.codex/skills/
cp -R scientific-toolkit-skill ~/.codex/skills/

使用示例:数据分析到论文

请依次使用 scientific-toolkit-skill 和 research-writing-skill。

第一阶段:
分析 data/experiment.xlsx,完成描述性统计、显著性检验和绘图。

第二阶段:
根据真实分析结果,撰写论文 Results 部分。

要求:
1. 保留全部分析代码
2. 图片导出为 PDF 和 PNG
3. 论文正文中的数字必须与结果文件一致
4. 不显著的结果不得写成显著
5. 不得编造样本量、P 值或实验结论
10
🏥
medical-research-skills
医学生物医学技能库 · 550+ Skills
生存分析 Meta 分析 单细胞
医学和生物医学专用技能库,包含 550+ 个 Skill,覆盖医学证据、研究方案、数据分析、学术写作,支持 PubMed 检索、系统综述、生存分析、Cox 回归、Meta 分析等。
GitHub: aipoch/medical-research-skills

550+ Skill 四大分类

  • Evidence Insights:PubMed 检索、系统综述、医学证据评价
  • Protocol Design:临床研究方案、样本量和统计功效
  • Data Analysis:单细胞和转录组、差异表达、WGCNA、免疫浸润、Kaplan-Meier、Cox 回归、ROC、列线图
  • Academic Writing:医学论文、Meta 分析、审稿意见回复

OpenClaw 一键安装

# Git Bash / WSL / macOS / Linux
bash <(curl -s https://raw.githubusercontent.com/aipoch/medical-research-skills/main/scientific-skills/scripts/openclaw-install.sh)

# 安装完成后
openclaw gateway restart

手动安装单个 Skill

git clone https://github.com/aipoch/medical-research-skills.git

mkdir -p ~/.claude/skills

cp -R \
  "medical-research-skills/scientific-skills/Academic Writing/peer-review-response-drafter" \
  ~/.claude/skills/

# Codex 用户将目标目录换成 ~/.codex/skills/

使用示例:生存分析

请调用与 Kaplan-Meier、Cox 回归和统计可视化相关的医学 Skill。

数据:data/clinical.csv

请完成:
1. 检查生存时间和结局变量定义
2. 检查缺失值和异常值
3. 生成 Kaplan-Meier 曲线
4. 运行单因素 Cox
5. 根据临床意义和统计原则建立多因素 Cox
6. 检查比例风险假设
7. 输出 HR、95% CI 和 P 值
8. 保存代码、表格和图片

不得自动把所有单因素显著变量直接塞入多因素模型。
⚠️ 医学属于高风险领域。Skill 生成的诊疗建议、研究设计和统计结论不能直接用于临床决策,必须经过医生、统计师和伦理审查。